Hola @lifealchemymx,
Es posible que no le hubieses asignado la ubicación de menú superior (o como le llame tu tema) al menú que has creado, por eso no está visible.
Fíjate en apariencia -> Menús -> Gestionar ubicaciones
Gracias por responder @mercedes-blogalizate. Pues veo que está ubicado como menú primario, ¿supongo que así debe de ser?
¿Solo tienes esa ubicación?
Si, sólo esa me aparece, abajo la opción de footer.
Ya chequé y no lo tengo deshabilitado. Por si ayuda lo siguiente: primero tenía un encabezado, transparent header me parece que se llama, y después descargué el plug in mencionado en mi post porque vi que podía hacer más cosas para mejorarlo. Fue entonces que desapareció el menú que había, y tampoco vi una opción de configurar uno nuevo con el este plug in, solo me aparece hacer uno con wordpress pero no sale estético ni cómo modificarlo.