Yo he visto ese reporte en mi propio tablero de Webmasters tools, pero, por lo menos en mi caso, se refiere a que se indexaron búsquedas.
Ese problema debería se soluciona usando direcciones canonicas, para que los buscadores sepan que se trata en todos los casos de la misma URI.
Y AIOS debería controlar esa configuración.
Yo también tenia es «sugerencia html» en webmaster tools y al no dar con una solución, desactive la creación automática de metadescripciones en el plugin All in One SEO.
Se que es radical pero es lo que ice. Si das con la solución…
http://wordpress.org/extend/plugins/seo-ultimate/
Excelente plugin, podes personalizar las meta descripciones en cada pagina.