Modificaciones en el archivo .htaccess

Hola, tengo la siguiente consulta.
Tengo un sitio manejado en wordpress con ciertos plugins, y quiero saber si existe la forma de que algun plugin puede modificar el archivo .htaccess por si solo.
Es decir, mi archivo no se modifica desde el FTP y en algunos casos se eliminan caracteres de ciertas lineas del mismo.
Puede pasar que un plugin modifique mi archivo??

Saludos.