No funcionan enlaces permantes

Buenos días, necesito ayuda.
Tengo instado WP en un subdirectorio de del directorio raiz (es un dominio independiente al principal). El problema es que cuando activo enlaces permanantes solo me muestra la home principal, pero el resto de páginas me da error 500.
He realizado varias pruebas en el htacces, incluso lo he eliminado (es como si no leyera este fichero los permisos son correctos) y sigo con el mismo error.

Puede alguien darme alguna pista.
Gracias.