Problema con los permisos

Buenos días, gracias por leer. Este es un problema que me viene siguiendo desde la semana pasada.

Tengo una página web bajo WordPress aprox hace ya 7 meses. Nunca tuve problemas, hasta hace 2 semanas, cuando al impedirme subir una imagen, empecé a investigar y, entrando por FTP a mi sitio web, descubrí que el propietario/grupo de la carpeta de mi instalación de WordPress había cambiado (y con este los permisos de los archivos) impidiéndome modificar cualquier archivo de la carpeta. Como estaba apurado y no encontraba solución, hice backup de todo y reinstalé WordPress una carpeta nueva, la cual estuvo en perfectas condiciones, hasta hace 3 días que volvió a tener el mismo error. Ahora tengo 2 carpetas en mi hosting que no puedo borrar ni modificar.

Investigando por internet leí que podía ser el archivo .htaccess, el wp-config o alguna otra cosa más, pero no logro hallar el problema.

Puede ser un virus? Un plugin? Me resulta extraño ya que, estuvo funcionando perfecto durante meses hasta hace 2 semanas.

Por si sirve, el usuario/grupo owner que me da el FTP es (1000/1000)

Desde ya gracias por leer y espero sus respuestas.