WordPress inutilizable después de restaurar back up

Buenos días, les describo mi problema:
Hace unas semanas mi web fue atacada por un backdoor(entiendo) que aparecía bajo la forma de «Mr_Entity wordpress uploader» en los plugins de WordPress, y una carpeta con nombre ininteligible con un peso considerable(unos 4gb). Entre los archivos de esa carpeta me pareció leer leafmailer(de ahí que piense que ha sido un backdoor). Cuando la vi, pensé en hacer una copia con Duplicator, me no me dejaba por el peso, así que hice una copia manual de todos los archivos excepto esa carpeta.
Después de eso actualizé todo lo que tenía falta de actualizar, que eran bastantes cosas, el tema y bastantes plugins.
Eso fue hace una semana, y ayer, que fue cuando vi que tenia el plugin «Mr_Entity wordpress uploader», le di a borrar y ahí fue cuando todo explotó.
Para resumir, aunque vi que salian cosas que no me cuadraban del servidor(tengo un vps), lo que pasó fue que se borraron bastantes archivos, las carpetas wp-admin y wp-includes volaron enteras, bastantes plugins, etc..

Lo que hice fue restaurar la copia de hace una semana que tenía, y aquí fue cuando vi mi error: no hice copia de las bases de datos. Ya que siempre las hacía el propio duplicator, no pensé en ello. Después de restaurar los archivos, borré archivos maliciosos que tenía de la anterior copia, muchos archivos con el nombre «th3_alpha.php» y varios con nombres aleatorios(no sé si me quedará alguno).

El probema actual:
No puedo ni instalar plugins, ni temas, ni borrar nada desde wordpress. Mi hipótesis es que al tener la base de datos actualizada(de aquí no se borró nada obviamente), con todos los cambios y actualizaciones últimos que hice recientes, pero los archivos desactualizados a las versiones anteriores de los temas/plugins, hay algún fallo que no me deja escribir desde el usuario que use wordpress para modificar archivos.

Esto de hecho me pasó hace un tiempo(lo de no poder borrar/actualizar nada) y creo que tenía que ver con el usuario que tiene nginx que interactúa con wordpress, o quizás con el docker.. no supe muy bien como lo resolví pero puede que vayan por ahí los tiros también.

Estoy bastante perdido, alguna idea de por donde empezar?

EDIT:
El error que me sale al intentar actualizar el tema es «No ha sido posible crear el directorio», de ahí que piense que puede ser por permisos de algún usuario del servidor.

• Este debate fue modificado hace 2 años, 5 meses por rodrigoplk.

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