Solucionado.
Tan solo poner estas lineas en el functions.php
add_filter(‘get_the_excerpt’, ‘do_my_shortcode_in_excerpt’); function do_my_shortcode_in_excerpt($excerpt) { return do_shortcode(wp_trim_words(get_the_content(), 55)); }
add_filter (‘new_excerpt_more’, ‘do_shortcode’);
Con ello podremos mostrar shortcodes en los Excerpt.